BMW R1200S, випущений у 2006 році, став наступником моделі R1100S (1998-), успішного спортивного мотоцикла з двоциліндровим двигуном. Робочий об'єм двоциліндрового двигуна з горизонтальним розташуванням циліндрів був збільшений з 1085 куб. см епохи R1100S до 1169 куб. см, а щоб відповідати титулу S, двигун був спеціально налаштований з посиленими коромислами і поршнями клапанів. Поршні також були спеціально розроблені, а максимальна потужність становила 122 к.с., що є найвищим показником для двоциліндрових двигунів боксерських мотоциклів. Двигун був встановлений в максимально високому положенні, щоб збільшити кут нахилу (кут, на який кузов може нахилятися при проходженні поворотів). Кут нахилу був встановлений на рівні 52°. Концепція дизайну передньої маски була перенесена з попереднього покоління R1100S. Ця конструкція з двома отворами в носовій частині була заснована на "нирковій решітці" (kidney - нирка, як у людини), що використовується на всіх чотириколісних мотоциклах BMW. Вони розташовані симетрично, як людські нирки). Дизайн решітки радіатора у вигляді нирки використовувався на кількох мотоциклах, найвідомішим з яких є R1200S (R1100S). Крім стандартної версії (Active Line), була доступна також просунута версія (High Line) з встановленою на заводі опціональною задньою підвіскою Öhlins, ABS і ручками з підігрівом.