Hypermotard 1100S був вдосконаленою версією Hypermotard 1100 (2007-), і як S-тип він отримав передні вилки з титановим покриттям (виробництва Marzocchi), задню підвіску Öhlins, моноблочні супорти Brembo, спеціальні полегшені колеса та карбонові накладки на вилки. Базова конфігурація, що включала 2-клапанний L-подібний двигун Desmodromic з повітряним охолодженням об'ємом 1078 куб.см, була такою ж, як і у стандартної моделі, яка випускалася до 2009 модельного року, а стандартна модель перетворилася на Hypermotard 1100 Evo наступного, 2010 року, коли з'явився тип SP (а не S). Hypermotard 1100 Evo SP) (див. окремий розділ).