У 2018 році Multistrada 1200 перетворилася на Multistrada 1260, а її старша версія, "S-версія", також отримала назву Multistrada 1260S. Об'єм двигуна Testastretta DVT (компактна головка зі змінними фазами газорозподілу) збільшено до 1 262 куб. см, а електронне управління шасі вдосконалено, як і на стандартній моделі. На додаток до цього, версія S оснащується напівактивною підвіскою Ducati Skyhook Suspension (DSS) EVO. Переднє гальмо оснастили чотирипоршневим моноблочним супортом Brembo M50, а діаметр гальмівних дисків збільшили до 330 мм. Ще одним елементом став швидкий перемикач швидкостей, який дозволяв перемикатися вгору і вниз без необхідності натискання на важіль зчеплення. Іншими відмінностями від стандартної моделі були повністю світлодіодні фари з поворотниками і 5-дюймовий повнокольоровий TFT-панель приладів.