CBR400RR був представлений у січні 1988 року як наступник CBR400R (NC23). Хоча це був наступник, за типом він все ще був NC23, і позиціонувався як еволюційна версія тієї ж моделі; під час буму гоночних реплік наприкінці 1980-х, він щороку зазнавав змін у специфікаціях, а також був привабливим для користувачів, змінивши назву моделі, щоб вона виглядала швидшою. Таким чином, можна сказати, що CBR400R еволюціонував у CBR400RR, хоча і NC23 (хоча модель була однаковою, обидва мотоцикли мали різні "класифікаційні номери"). Модель оснащувалася рядним чотирициліндровим двигуном з рідинним охолодженням і кулачковою передачею, яка приводила в рух розподільні вали за допомогою шестерень, а не ланцюгів, але її спортивні характеристики були значно покращені завдяки повному обтічнику з відмінними аеродинамічними характеристиками та радіальним шинам спереду і ззаду. У 1990 році модель зазнала повної зміни і була перейменована на NC29. Хоча базова конфігурація двигуна залишилася незмінною, впускна і випускна системи були перероблені, з майже лінійним розташуванням від повітроочисника до карбюратора і вихлопних отворів, а момент запалювання контролювався електронікою. Рама і підвіска також були спроектовані по-новому, з метою централізації маси (тобто не розміщувати важкі предмети так далеко від центру тяжіння кузова). 1994 модельний рік став завершенням історії моделі з кількома змінами в специфікації, але на той час бум на гоночні репліки вже відійшов у минуле.