CR125R - це спеціальна модель для змагань з мотокросу, оснащена 2-тактним двигуном Honda і була в лінійці з 1979 по 2005 модельний рік. 2-тактний одноциліндровий двигун об'ємом 125 куб.см залишався незмінним, але щороку мотоцикл зазнавав змін у технічних характеристиках, продуктивність покращувалась. Серед багатьох змін: двигун з водяним охолодженням (модель 1981 року), переднє дискове гальмо (модель 1984 року), заднє дискове гальмо (модель 1987 року), перевернуті вилки (модель 1990 року), алюмінієва двотрубна рама і п'ятиступінчаста трансмісія (модель 1998 року). Серед новинок - алюмінієва двотрубна рама і п'ятиступінчаста трансмісія (модель 1998 року). Його попередником був Elsinore CR125M (1970-), а наступником - CRF250R (2004-), який, хоча і був 4-тактним 250-кубовим двигуном, за правилами мотокросу належав до того ж класу, що й 2-тактний 125-кубовий двигун. Модель *CR125R призначена лише для змагань і не може бути ліцензована та їздити по дорогах загального користування.