ER-6f був представлений у 2006 році - спортивний мотоцикл з повним капотом, паралельним двоциліндровим двигуном рідинного охолодження об'ємом 649 куб.см, встановленим на трубчастій сталевій рамі, зі зміщеним заднім амортизатором з правого боку, серед інших конструктивних особливостей. У той же час була представлена модель ER-6n, а наступного року до неї приєдналася універсальна модель Versys, утворивши тріо сестринських моделей з однаковим двигуном; ER-6f проіснувала в лінійці близько 10 років після своєї появи в 2006 році, зазнавши за цей час дві повні зміни моделі. Класифіковані відповідно до ринкових кодів Kawasaki, моделі EX650A/B були доступні з 2006 по 2008 рік, EX650C/D з 2009 по 2011 рік і EX650E/F з 2012 по 2015 рік, а моделі EX650B, EX650D і EX650F були оснащені ABS. Моделі EX650B, EX650D і EX650F були оснащені ABS. Ця тенденція така ж, як і у "голої" версії ER-6n (ER650). Назва ER-6f в основному використовувалася в Європі, в той час як в Північній Америці його називали Ninja 650R або Ninja 650. Однак він також продавався в Північній Америці під назвою ER-6f. ER-6f постійно був міжнародною моделлю, але Ninja 650, який продавався в Японії з 2017 року, був моделлю в лінійці з точки зору спорту з повним капотом, який успадкував двигун ER-6f.