ZRX1200R, представлений у 2001 році, був великим рядним чотирициліндровим DOHC двигуном з рідинним охолодженням об'ємом 1164 куб.см, який мав на 2 мм більший діаметр циліндра та на 1 мм більшу діаметральну ширину горловини, ніж у ZRX1100. Цей двигун був розроблений на основі двигуна для GPZ900R (з 1984 року), який збільшив робочий об'єм більш ніж на 250 куб.см з початкових 908 куб.см. Оскільки робочий об'єм став ще більшим, двигун був переобладнаний на термічно сприятливий циліндр з покриттям. Слід зазначити, що попередник серії ZRX1100, який називався просто ZRX1100, був оснащений бікіні-капотом + квадратною фарою, в той час як ZRX1200R, в серії ZRX1200, був оснащений аналогічною специфікацією. Зовнішній вигляд ZRX1100 був збережений, але ширина задніх шин була збільшена, форма маятника змінилася, а колісна база подовжилася на 15 мм, серед інших незначних змін. Він також мав систему очищення, щоб відповідати нормам викидів. Варіанти включали ZRX1200 з круглою фарою (не продавався в Японії) і ZRX1200S з великим напівкапотом (продавався в Японії до 2004 модельного року) ZRX1200R отримав незначні зміни для 2004 модельного року, включаючи зміни в максимальній потужності (на 5 к.с. менше, але максимальний крутний момент досягається при 3500 об/хв). Інші зміни включали повномасштабний лічильник і вихлопні труби з полірованої нержавіючої сталі, які вироблялися до 2008 модельного року, а його наступник, ZRX1200 Daheg, був представлений в 2009 році.