Super Veloce S - це новий варіант, доданий до серії як модель 2021 року. Він позиціонується як топова версія Super Veloce 800 і був анонсований одночасно з тим, як Super Veloce 800 зазнав змін у специфікації, щоб відповідати європейським нормам токсичності викидів Євро-5. Таким чином, базова конфігурація, включаючи двигун (798-кубовий 4-тактний з рідинним охолодженням, паралельний 3-циліндровий DOHC) і раму з решіткою, була такою ж, як і у Super Veloce 800 після внесення змін до специфікації. Електронні системи керування, такі як швидкий перемикач передач, ABS на поворотах та трекшн-контроль, також були оновлені. Версія "S" відрізнялася спицьованими колесами і сидіннями з оббивкою з алькантари (штучної замші). Колісні диски використовувалися на лімітованих моделях Serie Oro (Золота серія) та MV Agusta 75th Anniversary, коли серію було запущено у виробництво. Те ж саме стосувалося і сидінь з алькантари. Також був доступний гоночний комплект. *Представлено у квітні 2021 року. На японському ринку з'явився в жовтні того ж року.