DR-Z400 був гоночним ендуро, випущеним одночасно з DR-Z400S у квітні 2000 року. Він мав таку ж базову конструкцію, як і DR-Z400S (для доріг загального користування), включаючи 4-тактний одноциліндровий DOHC 4-клапанний двигун з рідинним охолодженням і передньо-задню розділену напівдвійну люльку, але система запуску була з поштовхом, і він був приблизно на 16 кг легшим, ніж попередня модель DR-Z400S. DR-Z400 був змагальною машиною і не міг бути ліцензованим або використовуватися на дорогах загального користування.