Модель SS, одна з модифікацій Skywave 250, була випущена в січні 2005 року. Його появі передував великий бум кастомізації скутерів, який розпочався приблизно у 2000 році, коли виробники почали продавати моделі з базовою кастомізацією заздалегідь. Suzuki теж випустила Skywave 250 Type S, кастомізовану версію, оснащену коротким екраном і трубчастим кермом, у 2002 році, що зробило її основною моделлю лінійки Skywave 250. Skywave 250 SS був більш вдосконаленою версією цієї кастомізації. Вітрове скло було не тільки вкорочене, але й відсутнє, встановлена аеродинамічна маска в колір кузова, а форма сидіння була змінена за рахунок нижчої спинки водія. Кермо з пластинчастим стержнем було таким же, як і на Type S, але Skywave 250SS мав товстіші "дюймові стержні". Замкова щілина має автоматичний затвор, який відкривається при наближенні ключа (і закривається при віддаленні ключа).2008 року при зміні моделі двигун став DOHC з уприскуванням палива.Він був доступний до 2014 модельного року і не відповідав нормам викидів 2016 року, а в 2017 році його зняли з виробництва. Він випав з модельного ряду.