350R1 (YR1), представлений на Токійському мотосалоні попереднього року і запущений у виробництво в 1967 році, був суперспортивною моделлю, оснащеною двотактним двоциліндровим двигуном з повітряним охолодженням об'ємом 348 куб. см і паралельним розташуванням циліндрів, найбільшим на той час робочим об'ємом у лінійці Yamaha. Він був оснащений алюмінієвим циліндром з чудовим тепловідведенням, п'ятиступінчастою коробкою передач зворотного типу, подвійною рамою та триступеневою регульованою задньою підвіскою. Передні та задні шини були розроблені спільно з Dunlop і призначалися для високих швидкостей з новим малюнком протектора. Назву "R1" також використовували для суперспортивних моделей, що з'явилися наприкінці 20-го століття. До речі, фальшивий мотоцикл, який використовували винуватці "інциденту на 300 мільйонів ієн" у грудні 1968 року, був побудований на базі 350R1.