XJR1200R - це варіація XJR1200, представленого в 1994 році як найбільша водотоннажна гола модель в Японії, яка зазнала другої незначної зміни. Він був випущений в березні 1996 року. Він був оснащений великим напівобтічником (напівкапотом) і був налаштований як туристичний мотоцикл для подорожей на далекі відстані на високій швидкості. Повністю регульована задня підвіска Ohlins з демпфуванням відскоку і початковим (початковим) регулюванням і потрійними вимірювачами була такою ж, як і у фейсліфтінгового XJR1200 того ж року. 1998 року базова модель перетворилася на XJR1300, але модель з напівкапотом не пропонувалася, в результаті чого з'явився XJR XJR1200R був єдиною моделлю в серії з напівкапотом (оскільки XJR400R2 мав бікіні-капот).