Першим 50-кубовим Super Cub був Super Cub C100 1958 року. Історія другого покоління Super Cub почалася в 1966 році, коли двигун був переобладнаний з OHV на OHC (SOHC), і ця лінійка продовжилася після закінчення 20-го століття і в 21-му столітті. Наступна повна зміна моделі відбулася в 2012 році, а це означає, що Super Cub C50 виробляється вже 45 років. За цей час C50 зазнав цілого ряду змін, таких як додаткові моделі з різними технічними характеристиками, поява надпаливної моделі з двигуном 180 км/л (1983), Super Cub 50 Custom з рогатими фарами, запуск версії Street Custom (2002), а також моделі на честь 30-ї та 50-ї річниць з моменту запуску C100. Новий Super Cub 50, представлений у 2012 році, був бюджетною моделлю, виробництво якої було перенесено до Китаю; у листопаді 2017 року його знову модернізували, повернувши стандартну фару з круглими очима, як у дитинчат (водночас світлодіодну), і повернувши вітчизняне виробництво. У листопаді 2018 року ювілейна модель, присвячена 60-річчю Super Cub, була доступна для обмеженого замовлення (для обох Super Cub 110/50).