Випущений у грудні 1986 року, FZR250 (87 модельний рік) був гоночною реплікою з чотиритактним двигуном, на відміну від двотактної репліки TZR250. Це була четверта модель в серії FZR, після FZR1000, FZR750 і FZR400, і наступник FZ250 Fazer з точки зору робочого об'єму. По суті, рядний чотирициліндровий двигун Genesis Concept з кутом нахилу вперед 45° був вдосконаленою версією FZ250 Fazer, а система запалювання - повністю транзисторною версією FZR400. Модель 1988 року мала вихлопний пристрій EXUP від Yamaha. Двигун був оснащений вихлопним пристроєм EXUP від Yamaha, який збільшував крутний момент з 5 000 до 10 000 об/хв - практичного повсякденного діапазону обертів. Він також отримав глушник з еліптичним поперечним перерізом, який покращив імідж гонщика і зменшив об'єм вихлопних газів. Наступного, 1989 року, з'явився його наступник, FZR250R, який став завершенням модельного ряду FZR250.